近年來,由于測序技術(shù)的發(fā)展,越來越多與疾病相關(guān)的基因得到確認,作為精準(zhǔn)醫(yī)療的核心技術(shù),測序已經(jīng)應(yīng)用于產(chǎn)前篩查、遺傳病診斷、腫瘤診斷與治療等方面,尤其在攻克腫瘤這一難題前,基因測序給腫瘤的預(yù)防和治療提供了全新的思路。
但是從產(chǎn)業(yè)鏈角度來看,情況不容樂觀,測序儀的研發(fā)與生產(chǎn)壟斷在少數(shù)幾個大廠手中,測序巨頭 Illumina 更是占據(jù)了 70% 以上的市場份額,極高的行業(yè)壁壘,成為其它測序企業(yè)的發(fā)展障礙。所以當(dāng)前狀況下,突破二代測序儀的瓶頸成為測序公司制勝的關(guān)鍵,包括讀長、準(zhǔn)確度、精度、成本等。
四代測序則在不斷更迭的技術(shù)革新中蓄勢待發(fā)。
作為國內(nèi)少有的布局四代測序儀的公司,生輝關(guān)注到安序源生物科技有限公司(以下簡稱 “安序源”)的四代測序儀樣機近期亮相于深圳的一場展會,借此機會,生輝和安序源的聯(lián)合創(chuàng)始人兼首席執(zhí)行官田暉博士進行了交流。
圖 | 田暉博士(來源:受訪人提供)
田暉告訴生輝,“安序源的四代測序儀與牛津納米孔或其他公司相比區(qū)別較大。我們在保持納米孔測序長讀長優(yōu)勢的基礎(chǔ)上引入了酶促反應(yīng),用于生成可辨識度高的單堿基信號。相比傳統(tǒng)納米孔測序直接讀取待測核酸序列,這個技術(shù)路線具有幾個重大優(yōu)勢:首先,所采集信號來源大大簡化,是真正意義上的單堿基識別,提高了檢測信噪比;第二,搭配不同的樣品制備方法可以實現(xiàn)對同一個待測 DNA 模板的多次測序,開啟可控的高精度測量模式;此外,測量對象與 DNA 序列分離,突破傳統(tǒng)直流電壓驅(qū)動的限制,可以設(shè)計更靈敏更快速的極微小驅(qū)動及檢測單元來提高精度和擴大通量。我們實現(xiàn)這個技術(shù)路線的核心測量部件 —— 生物芯片具有的檢測單元數(shù)目超過同行幾個數(shù)量級,在單次加載 DNA 讀數(shù)通量上領(lǐng)先市場。而且芯片是在已量產(chǎn)成熟的先進半導(dǎo)體工藝上設(shè)計并生產(chǎn)的,比其他公司采用的特制化芯片價格更低廉?!?
“這意味著安序源的單芯片單次上樣即可實現(xiàn)高通量并行測序,提高測序深度和精度,而測序成本卻幾何級數(shù)下降。”他補充說。
同時他也提到,降低成本和提高準(zhǔn)確度之后,四代測序會很快迎來應(yīng)用爆發(fā)期。
生物芯片是底層技術(shù)
高靈敏度高通量低成本的半導(dǎo)體生物芯片是安序源的核心技術(shù)。生物芯片根據(jù)生物分子間特異相互作用的原理,將生化分析過程集成于芯片表面,從而實現(xiàn)對 DNA、蛋白質(zhì)等其它成分的高通量快速檢測,目前生物芯片的商業(yè)化應(yīng)用主要是快速多病毒聯(lián)檢、體外診斷、測序等。
2000 年,從斯坦福大學(xué)博士畢業(yè)后,田暉進入半導(dǎo)體領(lǐng)域,為相機制造 CMOS 圖像傳感器。CMOS 圖像傳感器本質(zhì)上是一種集成電路芯片,可以將光信號轉(zhuǎn)變?yōu)殡娦盘枺糜谑謾C、相機、攝像機、監(jiān)控等產(chǎn)品。
2013 年,田暉進入一家名為 Genia 的公司,進入生物技術(shù)行業(yè),負責(zé)高通量、高靈敏度芯片的研發(fā)和量產(chǎn)。2014 年,Genia 被羅氏收購,田暉隨之進入羅氏,擔(dān)任測序部副總裁。2016 年,田暉和聯(lián)合創(chuàng)始人 Igor Ivanov 創(chuàng)立了安序源。Igor Ivanov 同時擔(dān)任安序源的首席運營官,他曾在硅谷連續(xù)創(chuàng)辦幾家公司,其中一家成功在納斯達克上市,其余均被大公司收購,是一位成功的連續(xù)創(chuàng)業(yè)者。
圖 | Igor Ivanov 博士(來源:受訪人提供)
問及為何要從半導(dǎo)體行業(yè)轉(zhuǎn)向生物行業(yè),田暉告訴生輝,“基因測序能直接影響生命,而且有一個更廣闊的市場;測序技術(shù)是生命科學(xué)的底層技術(shù),可以應(yīng)用在很多方面;從半導(dǎo)體角度來說,打開了一個新的技術(shù)的應(yīng)用點;從生命科學(xué)的角度來說,帶來了新的技術(shù)平臺。”田暉認為自己是幸運的,因為最開始接觸的就是測序。
但是這一過程歷經(jīng)波折。
中國生物芯片研究起步較晚,始于 1997-1998 年,隨著生命科學(xué)的發(fā)展,生物芯片的研發(fā)才慢慢升溫。但是制作芯片的工藝流程復(fù)雜,對于環(huán)境的要求極高,所需的機器先進且昂貴。田暉也感慨道,“一般的公司是不可能自己來做半導(dǎo)體工藝的,因為太貴了,必須和半導(dǎo)體大廠合作”。