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科學(xué)怪咖Science革命性成果:構(gòu)建最小的基因組


  來源: 儀器儀表商情網(wǎng) 時間:2016-03-25 作者:Stanford
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儀器儀表商情網(wǎng) 科技前沿】CraigVenter博士被譽為是21世紀最頂尖的科學(xué)家之一。除了一些科學(xué)上的重要頭銜,他還是一位企業(yè)家,是J.CraigVenter研究所(JCVI)的創(chuàng)始人總裁兼CEO。在基因組學(xué)和合成生物學(xué)領(lǐng)域,CraigVenter一直是先行者。由于在人造人,以及對基因研究等方面的偏執(zhí)熱愛,其因此被戲稱為“科學(xué)怪人(BadboyofScience)”。

現(xiàn)在,在最新一期的Science雜志上,Venter宣稱設(shè)計并合成了一個最小的細菌基因組,它只含有維持生命所需的基因,組成它的基因只有473個。

2010年,CraigVenter在《科學(xué)》(Science)宣布了一項引起全球關(guān)注的革命性成果:構(gòu)建出了第一個能自我復(fù)制的合成細菌細胞,這代表著世界上首個人造生命細胞的誕生,是人類科學(xué)歷史上的一個突破性成果。該研究提供了概念證明:可以通過計算機設(shè)計,在實驗室中采用化學(xué)方法制造出基因組,并將其植入到受體細胞中生成僅由合成基因組控制的、可自我復(fù)制的新細胞。

自那以后,由Venter和ClydeHutchison領(lǐng)導(dǎo)的研究小組,便開始著手實現(xiàn)他們自1995年以來一直追求的終極目標:合成以最簡單的形式存在、只包含維持生命必需的基因的最小細胞。這項努力可以幫助科學(xué)家們了解細胞中每個必需基因的功能。

為此,Venter、Hutchison和同事們再次利用了支原體(Mycoplasma)——在所有自我復(fù)制細胞中這種細菌包含著已知最小的基因組。2010年,研究人員合成出了蕈狀支原體(Mycoplasmamycoides)的基因組。

在這里,基于現(xiàn)有的文獻,研究人員設(shè)計出了分為8個不同的片段、假設(shè)最小的基因組,并對每個片段進行了測試,以精確地歸類哪些組成基因是必需或非必需的。在這種設(shè)計-構(gòu)建-測試過程中,研究人員還試圖確定了準必需基因——即旺盛生長必需,但非生存絕對必需的基因。

在一系列的實驗中,Venter、Hutchison和同事們將一些轉(zhuǎn)座子(或外源基因序列)插入到了許多的基因中破壞它們的功能,以確定哪些基因是細菌全部功能所必需的。他們逐漸削減合成的減小的基因組,重復(fù)進行實驗直至再沒有基因可以被破壞,基因組已達到盡可能小的程度。至關(guān)重要地是,分析結(jié)果揭示一些最初被歸類為“非必需”的基因,事實上作為第二基因執(zhí)行了同樣重要的功能;因此,在最小基因組中需要保留成對基因其中的一個。

最終的版本被稱作為JCVI-syn3.0,包含有473個基因——這一基因組小于迄今為止自然界中存在的所有自我復(fù)制細胞的基因組。研究人員的最小基因缺乏所有的DNA修飾和限制基因,及大多數(shù)的脂蛋白編碼基因。相比之下,保留了參與讀取和表達基因組中遺傳信息的幾乎所有基因,及涉及保存跨代遺傳信息的基因。

有趣地是,大約31%的JCVI-syn3.0基因尚有待發(fā)現(xiàn)精確的生物學(xué)功能。但其中一些基因的潛在同系物存在于其他生物體中,表明它們編碼了功能有待確定的通用蛋白。這一JCVI-syn3.0平臺為調(diào)查生命的核心功能提供了一個通用工具。

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