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新型納米孔測(cè)序儀有望2017年推出


時(shí)間:2016-06-08 作者:五五
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 據(jù)Brown介紹,第一臺(tái)PromethIon測(cè)序儀已于近期交付給了客戶(hù)。他展示了該平臺(tái)的一些內(nèi)部數(shù)據(jù),使用的是48個(gè)模塊化流動(dòng)槽,每個(gè)含有3,000個(gè)通道。利用R9試劑,它的準(zhǔn)確性和孔利用率與MinION一致。PromethIon能夠在每次48小時(shí)的運(yùn)行內(nèi)獲得高達(dá)6.2Tb的數(shù)據(jù),未來(lái)有望增加至12.4Tb

此外,帶有R7納米孔的流動(dòng)槽將不再出售,而是被帶有R9納米孔的流動(dòng)槽取代。新的流動(dòng)槽采用更堅(jiān)固的膜和新的解旋酶馬達(dá)蛋白。Brown表示,公司在新的流動(dòng)槽上獲得的最長(zhǎng)讀長(zhǎng)達(dá)500kb,目前正致力于提高通量和均聚物檢測(cè)。

該公司表示,R9帶來(lái)更高的準(zhǔn)確性,特別是對(duì)于1D序列,即只讀取DNA的一條鏈。R9流動(dòng)槽以每秒250個(gè)堿基的速度測(cè)序,比之前R7的每秒70個(gè)堿基有很大提升,因此將大大提高MinION的產(chǎn)量。據(jù)Brown介紹,目前1D序列的準(zhǔn)確性接近90%,而2D序列則在95%左右。

隨著R9流動(dòng)槽的上市,Oxford Nanopore還將推出快速測(cè)序試劑盒。它的文庫(kù)制備只需要10分鐘,而且需要的耗材比以往更少,在MinION運(yùn)行開(kāi)始后立即分析數(shù)據(jù)。目前,這個(gè)試劑盒正被一些早期試用客戶(hù)測(cè)試,將盡快推出。

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