儀器儀表商情網(wǎng)報道 X射線晶體衍射技術(X-RAY CRYSTALLOGRAPHY)即將成為歷史,低溫電子顯微技術(CRYO-ELECTRON MICROSCOPY)引起了揭示細胞內隱秘機制的革命。
在劍橋大學一幢建筑的地下室里,一場技術革命正在醞釀。
一個笨重的、大約3米高的金屬盒子通過連接細胞的橙色纜線,安安靜靜地傳輸著以萬億字節(jié)計算的數(shù)據(jù)。這是世界上最先進的低溫電子顯微鏡之一:低溫電子顯微鏡通過電子束對冷凍的生物分子進行成像,從而得到分子的三維結構。站在這個耗資770萬美金的儀器旁,英國醫(yī)學研究委員會分子生物學實驗室(UK Medical Research Council Laboratory of Molecular Biology, LMB)的結構生物學家 Sjors Scheres表示,低溫電子顯微鏡非常敏感,一聲喊叫就會帶來極大誤差,導致實驗失敗。“英國需要更多低溫電子顯微鏡,因為未來它會成為結構生物學的主流?!?/span>
低溫電子顯微鏡震驚了結構生物學。過去30年里,低溫電子顯微鏡揭示了核糖體、膜蛋白和其它關鍵細胞蛋白的精細結構。這些發(fā)現(xiàn)都發(fā)表在頂級雜志上。結構生物學家們表示,毫不夸張地說,低溫電子顯微技術正處于革命之中:低溫電子顯微鏡能夠快速生成高分辨率的分子模型,這一點遠超X射線晶體衍射等方法。依靠舊方法獲得諾獎的實驗室也在努力學習這一技術。這種新模型能夠準確地揭示細胞運行的必要機制,以及如何靶向針對疾病相關的蛋白。
“低溫電子顯微鏡能夠解決很多以前無法解決的謎題?!迸f金山加利福利亞大學(University of California)的結構生物學家David Agard這樣說道。
幾年前Scheres被招進LMB,任務是幫助改進低溫電子顯微鏡,最終他成功了。上個月,他們發(fā)表了這個領域最令人振奮的成就:阿茲海默癥相關的酶的高清圖片,圖片包括該酶的1200左右個氨基酸,分辨率達到零點幾納米。
生物學家們如今仍在努力發(fā)展該技術,以期用它解決小分子或可變形分子的精微結構——這對低溫電子顯微鏡來說,也是一大挑戰(zhàn)。來自加利福利亞大學(University of California)的結構生物學家Eva Nogales表示,叫它革命也好,飛躍也好,低溫電子顯微鏡的確打開了一扇大門。
蛋白結晶
結構生物學領域有一條不成文的觀點:結構決定功能。只有知道生物分子的原子排布,研究者們才能了解這個蛋白的功能。例如,核糖體是如何根據(jù)mRNA的序列來制造蛋白,分子孔道是如何開和關的。幾十年來,分析蛋白結構有一個無冕之王——X射線晶體衍射。在X射線晶體衍射中,科學家們讓蛋白結晶,接著利用X射線照射,隨后根據(jù)X射線的衍射來重建蛋白的結構。在蛋白質數(shù)據(jù)銀行(Protein Data Bank)的100,000多條蛋白詞目里,超過90%的蛋白結構是利用X射線晶體衍射技術解析得到的。很多諾貝爾獎也與這一技術相關,例如1962年揭示DNA雙鏈螺旋結構的諾獎。
盡管X射線晶體衍射一直是結構生物學家的最佳工具,但是它有較大的限制。科學家們可能需要幾年才能找到把蛋白形成大塊結晶的方法。而很多基礎蛋白分子,例如嵌在細胞膜上的蛋白,或是形成復合體的蛋白卻無法被結晶。
當Richard Henderson 1973年到LMB,研究菌視紫紅質(一種利用光把質子運進膜內的蛋白)結構時,X射線晶體衍射是首選工具。Henderson和他的同事Nigel Unwin成功地做出了該蛋白的二維結晶,但卻不適用于X射線衍射。因此他們決定使用電子顯微鏡。